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《伤寒杂病论》确立的辨证论治原则，是中医临床的基本原则，是中医的灵魂所在。
张仲景把疾病发生、发展过程中所出现的各种症状，根据病邪入侵经络、脏腑的深浅程度，患者体质的强弱，正气的盛衰，以及病势的进退缓急和有无宿疾等情况，加以综合分析，寻找发病的规律，以便确定不同情况下的治疗原则。
书中收录药物的剂型很丰富，有汤剂、丸剂、散剂、灌肠剂、烟熏剂、栓剂、洗剂等。
《伤寒杂病论》记载了大量有效的方剂，共计269个（除重复的药方外，《伤寒论》有113方，《金匮要略》有262方），使用药物214味，基本概括了临床各科的常用方剂。
对中医临床影响深远，为后世遗留了百余首用之有效的经典名方，一直指导着后世医家的临床实践。
三、医学贡献卓着
（一）辨证论治体系创立
张仲景以六经论伤寒、脏腑论杂病，创造性地提出了包括理法方药为内容的辨证论治理论体系，使中医学的基础理论与临床诊断治疗紧密结合起来。
对于外感伤寒病，张仲景在《素问?热论》基础上，从整个外感病的发生、发展、变化过程入手，根据病邪侵害经络、脏腑的盛衰程度、病人的正气强弱以及有无宿疾等条件，寻找出伤寒发病的规律，提出了以六经论伤寒的辨证方法。
伤寒六经即太阳、阳明、少阳（三阳）和太阴、少阴、厥阴（三阴）。
三阳病多实热证，三阴病多虚寒证。
张仲景将经络所属脏腑作为辨证的理论依据，提出了伤寒传经途径。
在症候的变化方面，指出了八纲辨证论治的具体原则，并通过望、闻、问、切四诊，分析和检查疾病部位性质而归纳出来。
虽然论中未明确提及八法二字，但将临床基本治疗大法汗、吐、下、和、温、清、消、补等融会于诸篇经文及附方之中，更执简驭繁地确立了中医学治疗体系。
六经辨证论治体系是中医方法论的开端和诊疗思维的发源。
以此为基础，通过十几个世纪人类生命进程的观察，中医形成了对疾病发生发展规律和特征的多种认知方法，并通过不断的实践总结，最终整合在六经辨证论治体系之中，成为研究生命科学和疾病治疗的重要依据和思维工具。
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（二）方剂学贡献巨大
《伤寒杂病论》共载方360余首，许多名方一直被历代医家所沿用。
仲景方剂被称为“经方”
，经方在君、臣、佐、使的配伍运用和加减变化上具有严谨的法度，遣方用药，各具特点。
不仅如此，仲景遵循建立的辨证求因、审因立法、依法定方的原则为后世医家组方用药所效法。
如伤寒六经各有主证，主证有其主方，主方有其主药，根据病证变化，加减化裁，极其灵活。
方药剂量也颇有讲究，方中某一药物剂量的增损，即左右整个方剂性能。
在药剂制备方面，仲景也有着很广泛的运用，从《伤寒杂病论》所载诸方中，采用剂型种类甚为完备，除以汤剂为主要剂型外，还有丸剂、散剂、栓剂、灌肠剂、酒剂、醋剂、饮剂、煎膏剂、洗剂、浴剂、熏剂、滴剂、软膏剂等，这些剂型都有较详细的记载和施用方法。
（三）药物学认识深刻
张仲景对药物学的认识和运用具有很高的科学水平，主要表现在：一是重视生药的选择洗剔。
生药加工是中药制药不可分割的重要操作过程，根据药物的种类、功用不同，其加工方法有切、劈、破、咬咀、碎、研、捣、洗、浸等。
二是对药物的性能和功效有深入的理解。
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